Ministerstvo investícií, regionálneho rozvoja a informatizácie SR (do 30. 6. 2020 Úrad podpredsedu vlády SR pre investície a informatizáciu) ako Centrálny koordinačný orgán vydáva dňa 30. 10. 2020 Metodický pokyn k zadávaniu zákaziek s nízkou hodnotou nad 50 000 EUR (ďalej aj „metodický pokyn“) za účelom zabezpečenia jednotného postupu pri zadávaní zákaziek s nízkou hodnotou prijímateľmi nenávratných finančných príspevkov (ďalej len „NFP“) v hodnote nad 50 000 EUR bez DPH a ich kontrole/finančnej kontrole zo strany Riadiacich orgánov/Sprostredkovateľských orgánov. V prípade projektov, u ktorých sa neuzatvára zmluva o poskytnutí NFP a NFP sa poskytuje len na základe rozhodnutia o schválení žiadosti o NFP (t. j. v prípadoch, keď prijímateľ a poskytovateľ je tá istá osoba), postupuje Riadiaci orgán obdobne ako v prípade zmluvy o poskytnutí NFP.
Metodický pokyn sa vzťahuje na zákazky spolufinancované z fondov Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Európskeho sociálneho fondu, Kohézneho fondu, Európskeho námorného a rybárskeho fondu a programov EÚS, ktorých predpokladaná hodnota bez DPH sa rovná alebo presahuje 50 000 EUR, pričom ide o zákazky s nízkou hodnotou podľa § 117 zákona č. 343/2015 Z. z. o verejnom obstarávaní a o zmene a doplnení niektorých zákonov v z. n. p. (ďalej len „zákazky nad 50 000 EUR“) a zároveň je splnená podmienka, že takáto zákazka nie je zadávaná cez elektronické trhovisko alebo s využitím elektronického prostriedku použitého na elektronickú komunikáciu (napr. EVO).